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基于多粒度级联森林的骨质疏松性骨折预测研究

摘要:目的骨质疏松性骨折(osteoporotic fracture,OF)的预测对于骨折防范具有重要的临床指导意义。针对传统logistic回归预测模型存在的精度不高和未考虑遗传因子问题,本文引入多粒度级联森林(multi-grained cascade forest,gcForest)并结合遗传因子来预测OF。方法首先基于 t 分布邻域嵌入( t -distributed stochastic neighbor embedding, t -SNE)算法对OF关联基因位点进行非线性降维,降维后的基因位点与临床因素构成特征组。然后构建gcForest模型对OF进行预测。最后通过10次十折分层交叉验证与logistic、梯度提升决策树、随机森林进行对比。结果基于gcForest的模型分类精度为0.892 7,AUC值为0.92±0.05,泛化性能最优。结论在考虑遗传因素的条件下,gcForest分类效果优于其他模型,验证了本文方法的高效性和实用性。

关键词:
  • 机器学习  
  • 骨质疏松性骨折  
  • t分布邻域嵌入  
  • 随机森林  
  • 多粒度级联森林  
作者:
徐辉煌; 张海宇; 林勇
单位:
上海理工大学医疗器械与食品学院; 上海200093
刊名:
北京生物医学工程

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期刊名称:北京生物医学工程

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