摘要：目的了解辽宁省的肠道病毒71型的流行特征并对VP1区基因特征进行分析。方法用2008—2018年辽宁省14个市送检的手足口病患者的阳性标本,通过细胞培养法分离肠道病毒,提取病毒RNA,用RT-PCR法对肠道病毒VP1区基因扩增和序列测定。利用BLAST对测序结果比对后确定病毒基因型别。对鉴定为EV71的分离株进行VP1区同源性分析,并构建系统进化树。结果辽宁省在2008—2018年间实验室总计收到阳性标本24749份,其中最多的是其它肠道病毒(43.77%);其次是CA16(32.67%);EV71(23.2%)。随机原则选取66株EV71毒株,核苷酸同源性为94.80%~99.80%,氨基酸的同源性为98.50%~100.00%;与C4a参考株的同源性最高,核苷酸的同源性为94.00%~98.00%,氨基酸的同源性为98.50%~100.00%;系统进化树分析表明,辽宁省EV71分离株为C4a基因亚型。结论EV71是引起辽宁省手足口病的重要病原体,是引起重症及死亡病例的优势病原;EV71分离株为C4a基因亚型,并且在辽宁省内有多个传播链共同流行。