HI,欢迎来到好期刊网,发表咨询:400-888-9411 订阅咨询:400-888-1571证券代码(211862)

枣TCP家族基因鉴定及其表达分析

摘要:为了揭示枣TCP基因家族在枣生长发育中的作用,本文利用枣全基因组数据库搜索TCP家族基因,对该类基因进行鉴定、染色体分布等生物信息学和表达分析。结果表明,枣TCP基因家族包含22个成员,蛋白长度范围为172~590个氨基酸,等电点为4.88~5.25,全部为亲水蛋白;其中15个基因分布在6条染色体上,5号染色体最多,有4个;聚类分析发现,该类基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ2类,ClassⅡ又分为CYC/TB1和CIN亚类;组织特异性表达分析表明,该类基因主要在叶、蕾、花和果中表达;同时,植原体侵染对该类基因的表达有显著影响。蛋白互作预测发现ZjTCP和其他蛋白以及同一家族蛋白内部之间均可以发生互作。本研究结果为进一步研究该类基因的功能提供了重要线索和依据。

关键词:
  • 枣  
  • tcp转录因子  
  • 鉴定  
  • 生物信息学分析  
  • 表达分析  
作者:
赵一彤; 魏戏梦; 薛超玲; 李景刚; 赵锦
单位:
河北农业大学生命科学学院; 河北保定071000; 白沟新城物流服务中心; 河北保定074000
刊名:
河北农业大学学报

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

期刊名称:河北农业大学学报

河北农业大学学报紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1959年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。