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利福平和甲基磺酸甲酯对感染植原体毛泡桐中长链非编码RNA变化的影响

摘要:为研究与泡桐丛枝病相关的长链非编码RNAs(lncRNAs),以毛泡桐(Paulownia tomentosa)的健康苗、患丛枝病的病苗及分别用100 mg·L^-1的利福平和60 mg·L^-1甲基磺酸甲酯处理病苗得到的处理苗为试验材料,利用高通量测序技术研究病健苗及试剂处理苗中的lncRNAs及相应靶基因的表达情况。共鉴定出3 700个lncRNAs,2 219个靶基因,从中得到389个差异表达的lncRNAs和对应的203个靶基因,并对其靶基因进行了GO功能分类。通过方案设计鉴定得到3个与泡桐丛枝病相关的lncRNAs,预测其对应的靶基因分别为磷脂酶D、蛋白磷酸酶以及WNK赖氨酸缺乏蛋白激酶。采用实时定量PCR技术验证随机挑选的5个lncRNAs及其靶基因,验证结果与高通量测序结果一致。

关键词:
  • 毛泡桐  
  • 丛枝病  
  • 长链非编码rna  
  • 利福平  
  • 甲基磺酸甲酯  
作者:
李小凡; 曹喜兵; 赵振利; 王哲; 赵晓改; 邓敏捷; 范国强
单位:
河南农业大学泡桐研究所; 河南郑州450002
刊名:
河南农业大学学报

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期刊名称:河南农业大学学报

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