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胃癌转移的分子特征分析及预后评估

摘要:目的利用生物信息学分析转移性胃癌和原位胃癌的在分子水平的差异,揭示转移性胃癌进展机制,为精准诊疗和预后评估提供潜在的分子靶点。方法从TCGA公共数据库获取胃癌患者RNA-Seq及DNA甲基化芯片数据,筛选转移性胃癌和原位胃癌在两个组学维度的一致性差异基因,评估其功能及富集通路并进行风险回归分析。结果筛选出一致性差异基因170个,转移组上调基因52个、下调基因118个。功能分析提示免疫调节、细胞分化、外源信号感应、自噬与溶酶体转运、药物及蛋白代谢等信号通路与转移性胃癌发生有关。针对上述基因进行预后风险评估,发现RTP3、GTF3C5、TMEM102、NHLRC3、FUT2、PGAP2、AAMP是与转移风险相关的7个关键基因,其联合表达信号可用于胃癌患者的预后评估。结论由7个关键基因组成的联合因子可为胃癌预后评估提供依据,是临床检测的潜在生物学标记物。

关键词:
  • 胃癌  
  • 转移  
  • 分子标记  
  • 差异基因  
作者:
陈奇; 武惠韬; 孙金秀; 薛万国; 石金龙
单位:
解放军总医院医疗大数据中心; 北京100853
刊名:
解放军医学院学报

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期刊名称:解放军医学院学报

解放军医学院学报紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:10-1117/R。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1980年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。