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青稞叶绿体基因RNA编辑位点的预测、鉴定与比较分析

摘要:为了阐明青稞叶绿体基因组RNA编辑位点的组成与特性,首先利用生物信息工具对青稞叶绿体基因的RNA编辑位点进行了预测,结果发现了35个分布于15个基因的编辑位点,所有编辑均为C到U的转换,其中基因ndhB包含的编辑位点数量最多,达9个,这与其他麦类作物相似;进一步利用RT-PCR结合克隆测序,对预测的35个位点进行了实验验证,发现18个编辑位点被证实发生了C到U的编辑;对编辑前后编码蛋白质的结构进行了比较分析,发现RNA编辑引起了编码蛋白的结构变化,暗示RNA编辑可以造成编码蛋白功能的改变。最后,将青稞叶绿体基因RNA编辑位点与栽培大麦、野生大麦的叶绿体RNA编辑位点进行了比较,发现青稞与栽培大麦的RNA编辑组成完全一样,而野生大麦缺失了ndhA-563位点,初步印证了大麦的起源进化关系。

关键词:
  • 青稞  
  • 叶绿体  
  • rna编辑  
作者:
昌西; 裴悦; 胡凡; 任苗苗; 王彤; 聂小军
单位:
西藏农牧学院植物科学与技术学院; 西藏林芝860000; 西北农林科技大学农学院; 陕西杨凌712100
刊名:
麦类作物学报

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期刊名称:麦类作物学报

麦类作物学报紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:61-1359/S。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1981年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。