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吉陶单极虫可分泌蛋白酶基因的克隆与生物信息学分析

摘要:粘孢子虫为鱼类主要的寄生虫,给渔业的生产造成严重的危害。近年来,粘孢子虫的蛋白酶以及抑制剂在入侵和感染宿主中的作用被越来越多的报道。在前期粘孢子虫吉陶单极虫转录组数据的基础上,成功克隆了3个可分泌蛋白酶基因:TK Papain-1、TK Papain-2和TK Pepsin,并且通过异源表达得到了与预测蛋白大小相符的蛋白。通过生物信息学的分析发现,TK Papain-1、TK Papain-2属于Papain (C1A)家族成员,均编码半胱氨酸蛋白酶,分别编码150个和322个氨基酸,蛋白大小为17.06 kDa和36.7 kDa;TK Pepsin编码天冬氨酸蛋白酶,编码491个氨基酸,编码蛋白理论大小为55.41 kDa。3个可分泌蛋白酶均有信号肽序列,为可分泌蛋白;通过进化树的构建,发现与海葵、水螅、纤毛虫同源序列亲缘关系较近。通过多序列比对,找到了可分泌蛋白酶的保守位点。研究结果为进一步深入粘孢子虫蛋白酶性质及感染机制方面的研究提供了基础。

关键词:
  • 粘孢子虫  
  • 蛋白酶  
  • 生物信息学分析  
  • 克隆  
  • 表达  
作者:
张凤丽; 杨雅麟; 夏锐; 高辰辰; 李栋; 冉超; 张震; 张洪玲; 周志刚
单位:
中国农业科学院饲料研究所; 农业农村部饲料生物技术重点实验室; 北京100081; 中国农业科学院饲料研究所; 中国-挪威鱼类消化道微生物联合实验室; 北京100081
刊名:
生物技术进展

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期刊名称:生物技术进展

生物技术进展杂志紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:33-1375/Q。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于2011年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。