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PAIP1结合RNA测序及整合分析

摘要:目的分析PAIP1结合RNA的分子特征,探讨PAIP1的新功能。方法采用Illumina Xten测序平台对HeLa细胞进行建库测序,通过对PAIP1结合RNA进行整合分析,分析PAIP1结合RNA的分子特征,对PAIP1结合靶基因进行KEGG聚类分析。结果PAIP1具有广泛的RNA结合活性,结合显著富集在CDS和Intron区域;KEGG分析表明,PAIP1结合的RNA分子主要参与了焦点粘连、剪切体、RNA转运、蛋白多糖在癌症中的作用、HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路。结论PAIP1具有结合RNA分子的功能,是一个新的RNA结合蛋白,可能在肿瘤的发生、发展过程中发挥作用。

关键词:
  • paip1  
  • rna结合蛋白富集测序  
  • rna结合蛋白  
作者:
郑剑锋; 杨峻; 李金平; 杨小洁; 邵文华; 秘思思
单位:
深圳市宝安区中心医院; 深圳大学第五附属医院; 广东深圳518102; 桂林医学院; 广西桂林541004
刊名:
实验与检验医学

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期刊名称:实验与检验医学

实验与检验医学杂志紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:36-1298/R。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1983年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。