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油菜开花期QTL定位和候选基因分析

摘要:为辅助选育早熟油菜品种、克隆油菜开花期基因及开发花期分子标记,以已测序的油菜品种中双11(Z)和重测序的油菜品系No.73290(N)为亲本构建的含184个单株的BnaZNF2群体为材料,通过分析该群体的基因型数据和F2:3家系连续三年(2010-2012)在武汉的表型数据,对开花期QTL进行检测和整合,定位到分布在11个连锁群上的14个开花期QTL。其中只有5个QTL能在3年中重复检测到,分别是qDtF.A2-1、qDtF.A6-2、qDtF.C2-1、qDtF.C2-2和qDtF.C3-1,贡献率在7.1%~21.1%之间。通过查阅文献和在拟南芥、水稻等作物网站上搜索,搜集到442个与植物开花期有关的基因。基于油菜基因组物理图谱,通过生物信息学分析,在本研究定位的QTL区间上筛选到54个可能的候选基因,可以用于开花期基因的克隆。在5个主要QTL区间内分别定位到8、5、4、2和4个候选基因,其中有15个在双亲中存在序列差异,可以开发开花期的功能标记用于分子标记辅助选择育种。

关键词:
  • 甘蓝型油菜  
  • 早熟  
  • 开花期  
  • qtl  
  • 候选基因  
作者:
魏雅琪; 危文亮; 刘道敏; 张江江; 詹杰鹏; 师家勤; 王新发; 刘贵华
单位:
长江大学; 湖北荆州434025; 中国农业科学院油料作物研究所; 湖北武汉430062; 六安市农业科学研究院; 安徽六安237000
刊名:
中国油料作物学报

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期刊名称:中国油料作物学报

中国油料作物学报紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:42-1429/S。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1979年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。