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我国九省(市、区)82株嗜肺军团菌血清1型菌株的序列分型

摘要:目的了解我国环境水中嗜肺军团菌血清1型(Lp1)菌株的序列分型特征,并初步建伊我国军团菌序列分型数据库。方法采用序列分型(SBT)方法,对我国9个省(市、自治区)2005--2008年问环境水中分离的82株如1菌株进行分型,同时采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对这些菌株进行分型,并采用BioNumerics5.1软件对2种方法的分型结果进行聚类分析和比较。结果82株Lp1菌株分为22种序列(sT)型,其中17种ST型是新序列型,新发现1个等位基因;ST-1型为主要的序列型,在8个省(市、自治区)均有发现,该型菌株占所有菌株的46.3%(38/82);ST.1、ST.150、ST-154、ST-159、ST-160和ST-630出现于2个以上的分离地点,5个分离位点(B4、B5、B6、S3和S8)发现2种以上ST型;通过聚类分析,15种ST型被分为3个序列群(ST-1序列群、ST-154序列群和ST-149序列群),其余7种ST型没有序列群归类。采用PFGE分型方法,这些菌株可被分为46种带型。SBT和PFGE两种方法结合可将82株菌株分为54种分子型别。两种方法的聚类分析结果具有良好的-致性。结论我国环境水中Lp1菌株具有独特的SBT分布;通过研究,初步建立了我国军团菌序列分型数据库。

关键词:
  • 军团病杆菌  
  • 嗜肺  
  • 细菌分型技术  
  • 电泳  
  • 凝胶  
  • 脉冲场  
作者:
朱兵清; 任红宇; 周海健; 秦天; 邵祝军
单位:
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室; 北京102206
刊名:
中华预防医学

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期刊名称:中华预防医学

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