HI,欢迎来到好期刊网,发表咨询:400-888-9411 订阅咨询:400-888-1571证券代码(211862)

基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析

摘要:生长素反应因子(AuxinResponseFactors,ARFs)是植物特有的多基因转录因子家族,参与植物生长发育过程的调节。本研究基于转录组数据,通过生物信息学方法鉴定剑麻ARF基因家族成员,同时对其进行相关生物信息学分析。结果表明:在剑麻中共鉴定得到15个ARF基因,并依次命名为AhARF1~15。其编码的蛋白质含有409~1011个氨基酸,分子量约为45.17~112.13ku,等电点为5.17~9.34。亚细胞定位预测结果显示,13个AhARFs定位于细胞核,2个AhARFs定位于叶绿体。保守结构域分析结果表明,AhARFs基因家族有8个成员同时含有B3、ARF和Aux/IAA这3个相对保守的结构域,其他成员仅含有B3和ARF这2个结构域。进化树分析表明,剑麻AhARFs蛋白可分为5个亚家族。15个剑麻AhARFs基因在剑麻紫色卷叶病不同发病时期呈现不同的表达规律。本研究为进一步深入探索剑麻ARF基因家族的功能奠定了重要理论基础。

关键词:
  • 剑麻  
  • arf  
  • 基因家族  
  • 转录组  
作者:
鹿志伟; 侯晓婉; 杨子平; 张燕梅; 李俊峰; 周文钊
单位:
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所; 广东湛江524091; 湛江市热带作物遗传改良重点实验室; 广东湛江524091
刊名:
热带作物学报

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

期刊名称:热带作物学报

热带作物学报紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:46-1019/S。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1980年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。