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基于转录组测序探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA

摘要:目的:基于转录组测序注释,探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培养基2216E中培养创伤弧菌MO6-24/O,收集从对数生长期到静止期不同时间点的细菌,提取细菌RNA,通过富集sRNA以及去除核糖体RNA进行建库和测序,然后将读段匹配到创伤弧菌MO6-24/O基因组并进行注释,最后进行验证。结果:发现59个顺式编码sRNA、102个反式编码sRNA,并进行了部分验证。结论:鉴定出创伤弧菌MO6-24/OsRNA。

关键词:
  • 创伤弧菌  
  • 小rna  
  • 转录组测序  
作者:
周亚男; 李宗城; 张晓彤; 胡成进; 应晓敏; 曹源
单位:
潍坊医学院医学检验学系; 山东潍坊261053; 解放军第九六〇医院实验诊断科; 山东济南250031; 解放军总医院第五医学中心南院区肿瘤学研究室; 北京100071; 军事医学研究院军事认知与脑科学研究所; 北京100850
刊名:
生物技术通讯

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期刊名称:生物技术通讯

生物技术通讯杂志由军事医学科学院生物工程研究所主办,军事医学科学院主管的学术刊物,国内刊号为:11-4226/Q。创办于1989年,双月刊,在全国同类期刊中发行数量名列前茅。其主要栏目有:研究报告、技术方法、综述、其他等。